Les anàlisis de metodologies òmiques individuals, com la seqüenciació de ADN i ARN, seqüenciació de proteïnes, expressió gènica, assemblatges de genoma, anàlisis de PTM, la interacció proteïna-proteïna i identificació i quantificació de metabòlits, entre altres…
Àcids nucleics i proteïnes
Els àcids nucleics, i l'ADN en particular, són macromolècules que tenen tota la informació sobre com i quan s'han de construiïr les proteines.
L’expressió gènica és el procés mitjançant el qual la informació continguda en els gens d'una seqüència d'ADN es transcriu en RNA i, posteriorment, es tradueix en proteïnes funcionals, proporcionant una visió detallada del comportament molecular dels gens en diferents condicions i contextos biològics.
Treballarem amb els formats textuals de seqüenciació d'ADN, ARN i proteïnes més habituals en bioinformàtica, el FASTA i el Genbank; i també repassarem d'altres de coneguts.
Entrez és un motor de cerca de l'institució pública NCBI que integra diverses bases de dades de ciències de la salut. Ofereix de manera gratuïta molta informació genòmica d'alt rendiment, a través de la API anonimitzada d'Entrez.
Les proteïnes són una de les molècules orgàniques més abundants en els sistemes vius i són molt més diverses en estructura i funció que altres classes de macromolècules. Totes les proteïnes es componen d'una o més cadenes d'aminoàcids.
Análisis de seqüències
L'alineament de seqüències és un mètode computacional que permet inferir informació biològica només a partir de la informació que tenen les seqüències.
Blast és l'eina principal de l'NCBI per comparar una seqüència d’ADN o proteïna amb altres seqüències de diverses bases de dades
undefined