Informàtica mèdica
Anàlisis de dades
| Numpy | Numpy és una biblioteca que ens permet gestionar matrius, tipat estàtic i realitzar càlculs científics. Moltes llibreries potents de Pyhton requereixen importar Numpy. |
| Matplotlib | Matplotlib és una llibreria de baix nivell que serveix per dibuixar figures, funcions i tot tipus de gràfiques en imatges estàtiques. Funciona molt bé amb qualsevol estructura de dades de Python. |
| Pandas | Pandas és una biblioteca que proporciona estructures de dades tabulades que gestionin grans volums de dades de forma eficient. Permet ordenar, agrupar i obtenir estadístiques fàcilment. Juntament amb altres llibreries, permet visualitzar dades amb gràfics i mapes útils i atractius. |
| Estadística | Estadística descriptiva, mesures de centralització, dispersió, outliers, correlació entre variables i corbes distribució. Amb gràfics en Seaborn per il·lustrar tots els conceptes. |
| Pandera | Pandera proporciona una API flexible i expressiva per dur a terme la validació de dades en objectes dataframe per tal que el processament de dades sigui més entendible i robust. |
| Polars | Polars ofereix un rendiment superior a Pandas al tractar DataFrames de gran tamany, especialment en consultes. Per provar-ho usarem el terminal de Linux o de Windows per filtrar fitxers, de text pla i tamany superior a 5 MB. |
Visualitazció de dades
| Plotly | undefined |
Ciències òmiques
Àcids nucleics i proteïnes
| Àcids nucleics | undefined |
| Expressió gènica | L’expressió gènica és el procés mitjançant el qual la informació continguda en els gens d'una seqüència d'ADN es transcriu en RNA i, posteriorment, es tradueix en proteïnes funcionals, proporcionant una visió detallada del comportament molecular dels gens en diferents condicions i contextos biològics. |
| Formats de seqüències | undefined |
| Entrez | undefined |
| Proteines | undefined |
Análisis de seqüències
| Alineament de seqüències | undefined |
| Blast | Blast és l'eina principal de l'NCBI per comparar una seqüència d’ADN o proteïna amb altres seqüències de diverses bases de dades |
| Alineament múltiple de seqüències | undefined |