Informàtica mèdica
Anàlisis de dades
| Numpy | Numpy és una biblioteca que ens permet gestionar matrius, tipat estàtic i realitzar càlculs científics. Moltes llibreries potents de Pyhton requereixen importar Numpy. |
| Matplotlib | Matplotlib és una biblioteca que serveix per dibuixar figures, funcions i tot tipus de gràfiques en imatges estàtiques. |
| Pandas | Pandas proporciona estructures de dades tabulades per a gestionar grans volums de dades de forma eficient. Permet ordenar, agrupar i obtenir estadístiques fàcilment. |
| Estadística | Estadística descriptiva, mesures de centralització, dispersió, outliers, correlació entre variables i corbes distribució. Amb gràfics per il·lustrar tots els conceptes. |
| Pandera | Pandera proporciona una API flexible i expressiva per dur a terme la validació de dades en objectes dataframe per tal que el processament de dades sigui més entendible i robust. |
| Polars | Polars ofereix un rendiment superior a Pandas al tractar DataFrames de gran tamany, especialment en consultes. Per provar-ho usarem el terminal de Linux o de Windows per filtrar fitxers, de text pla i tamany superior a 5 MB. |
Visualitazció de dades
| Plotly | undefined |
Ciències òmiques
Àcids nucleics i proteïnes
| Àcids nucleics | undefined |
| Expressió gènica | L’expressió gènica és el procés mitjançant el qual la informació continguda en els gens d'una seqüència d'ADN es transcriu en RNA i, posteriorment, es tradueix en proteïnes funcionals, proporcionant una visió detallada del comportament molecular dels gens en diferents condicions i contextos biològics. |
| Formats de seqüències | undefined |
| Entrez | undefined |
| Proteines | undefined |
Análisis de seqüències
| Alineament de seqüències | undefined |
| Blast | Blast és l'eina principal de l'NCBI per comparar una seqüència d’ADN o proteïna amb altres seqüències de diverses bases de dades |
| Alineament múltiple de seqüències | undefined |